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各门类古生物化石的具体鉴定方法不尽相同，但一般都要经过下述步骤：
①
熟悉标本外部形态和内部构造，对大化石的细微构造或微体化石，一般需要借助实体镜、显微镜或电子显微镜进行观察。有时要将化石做连续切片,以便于了解其内部构造特征;
②
利用所具有的知识并查阅有关文献,确定较大的分类阶元,一般定到科；
③
利用检索表、图版等文献资料， 将标本进一步检索到属、种；
④
选择有代表性的种群标本或典型的单个标本进行特征描记，度量各种性状要素及照相。

标本鉴定以后，要进行记述。一个古生物种的完备记述，按顺序包括下列各项：学名、图版、同异名录、模式(种群)标本的编号和保存地点、鉴定要点、描述、度量及其他数据资料讨论、产地和层位。

动物化石的形成和保存主要与以下条件有关：⑴生物体是否具有由化学性质较稳定的物质组成的硬体(如贝壳、骨骼等)，具有硬体的生物保存为化石的可能性较大;⑵生物遗体或遗迹所在环境的物理化学条件是否适合于保存，波浪作用强烈的水域环境不利于生物遗体和遗迹的保存;当环境介质的PH值小于7.动物化石时，由碳酸钙组成的生物硬体容易受到溶蚀，故也不利于生物遗体的保存;氧化条件下不利于有机质的保存;⑶生物死亡后是否迅速被埋藏，如果生物死亡后，它的遗体能够被迅速而长期埋藏，那就比较容易形成化石;⑷沉积物的类型对化石的形成和保存也有重要影响;如果生物遗体被化学沉积物(如CaCO3)或生物成因的沉积物所掩埋，形成化石的可能性比较大;⑸在沉和物固结成岩的化石过程中，强烈的压实作用和重新结晶的作用，不利于动物化石的形成和保存。由于形成动物化石的条件不同，保存在岩层中的化石也有不同类型。

1984年在中国出土一件有6500万年的历史的“恐龙蛋窝”化石。本“恐龙蛋窝”化石出土之后，几经辗转流失到中国境外，此件“恐龙蛋窝”化石包含22枚盗蛋龙恐龙蛋，其中19枚恐龙蛋中可见初具雏形的恐龙胚胎。2003年，一名美国收藏家在美国公开拍卖会上以42W美元将其买下，后经多方交涉无偿归还中国。这也是中国政 府首 次通过外交途径追索流失国外的古生物化石

现在，化石专指史前生存但被自然埋藏和保存的的残体。多年之迷希腊哲学家认为化石是十分奇怪的自然现象，就像水晶和钟石一样是在地下形成的。马丁·路德(1483/u1546)相信在山峰上发现的化石是《圣经》之血的证据。列奥纳多·达·芬奇(1452～1519)在他的笔记中写到：化石是曾经生存过得体的石化残体。他的观点在那个时代被认为是异端邪说，直到19世纪，他的笔记才被公开。

动物化石能提供环境标志，判断和恢复古沉积环境，建立古生物和现代生物的亲缘关系.如浮游有孔虫，放射虫，牙形刺等仅产于海相沉积中;如中，新 生代的轮藻，某些介形虫和硅藻仅产于陆相的淡水沉积中;某些底栖有孔虫和介形虫及少数的轮藻，产于滨海的边缘环境的半咸水沉积等等。这些不同类别的古生物在其生存期间，对于水域的温度，盐度，深度，浑浊度和沉积底性等都有一定的要求。